Trứng có thể bị nhiễm vi khuẩn Salmonella theo hai cách. Vi khuẩn có thể xâm nhập từ bên ngoài qua vỏ trứng hoặc lây nhiễm từ bên trong nếu gà mái mang Salmonella và vi khuẩn được truyền vào trứng trước khi lớp vỏ hình thành. Việc xử lý, bảo quản và chế biến đúng cách đóng vai trò quan trọng trong p