Đại đội 45 được thành lập năm 1962, thuộc Khu Tuần phòng II, Hải quân nhân dân Việt Nam. Nhiệm vụ chính là bảo vệ vùng biển hai tỉnh Nghệ An và Hà Tĩnh. Năm 1965, khi đế quốc Mỹ leo thang mở rộng chiến tranh ra miền bắc, Đại đội được chuyển về trực thuộc Tỉnh đội Hà Tĩnh và phối hợp chiến đấu với qu